占地面积大：由于其结构特点和承重需求，门式起重机需要占用较大的地面空间，这对于场地有限的场所来说是一个不利因素。

操作灵活性受限：虽然操作相对简便，但门式起重机无法实现水平运输功能，必须与其他运输工具配合使用，且操作过程需要专业技能和高度警惕性。

油耗和维护成本高：门式起重机在运行过程中需要较大的动力支撑，因此油耗相对较高。同时，为保证其正常运行和安全可靠，需要定期进行维护和检修，这也增加了使用成本。

受环境影响大：在室外使用时，易受雨水腐蚀生锈，且受风向影响时可能无法正常工作，需要采取固定措施。

综上所述，门式起重机虽然具有诸多优点，但在实际应用中也存在一些不足之处。在选择和使用时，需要综合考虑其优缺点以及具体工作环境和需求。